لم يأت اختبار اسم الأمام جعفر الصادق (ع) عنوانا للجامعة محض صدفة او رغبة عابرة بل جاء اختيار هذا الاسم المبارك لرسم ابعاد هوية الجامعة وتعميق أهدافها في نفوس العالمين والدارسين فيها.لان الامام جعفر الصادق (ع) يعتقد الجميع بدوره العلمي والثقافي الرائد في الحياة الإسلامية كما يعترف علماء التأريخ الإسلامي على تأثيره الكبير في نشأة علم الفقه وتطوره على يد أئمة المذاهب.